臺北醫學大學原名臺北醫學院，創立于1960年6月1日，是醫學專家暨熱心醫藥教育人士胡水旺先生與徐千田先生等所捐資創設。創校之初，校地盡是一片荒蕪水田，教學與研究資源匱乏，四十八年來，在歷(li)屆校(xiao)長的努力(li)下，從創校(xiao)之(zhi)三學(xue)(xue)系二(er)專科，擴展為現有醫(yi)學(xue)(xue)院、口腔醫(yi)學(xue)(xue)院、藥學(xue)(xue)院、護理學(xue)(xue)院、公共衛生暨(ji)營(ying)養學(xue)(xue)院五個(ge)學(xue)(xue)院，十三學(xue)(xue)系及十三研究所之(zhi)規模(mo)。自從2000年改名臺北醫(yi)學(xue)(xue)大學(xue)(xue)以(yi)來，便一直以(yi)成為國際一流醫(yi)學(xue)(xue)大學(xue)(xue)為目(mu)標(biao)，持續努力(li)。
在教(jiao)(jiao)(jiao)學(xue)(xue)方面，作為一(yi)所都會型醫(yi)學(xue)(xue)專(zhuan)業大學(xue)(xue)，臺北(bei)醫(yi)學(xue)(xue)大學(xue)(xue)的(de)教(jiao)(jiao)(jiao)育(yu)理(li)念，在于教(jiao)(jiao)(jiao)導學(xue)(xue)生醫(yi)學(xue)(xue)專(zhuan)業知識(shi)之(zhi)外，同時重視(shi)博(bo)雅(ya)教(jiao)(jiao)(jiao)育(yu)，回(hui)歸以(yi)人(ren)為本的(de)教(jiao)(jiao)(jiao)學(xue)(xue)。在這(zhe)樣的(de)理(li)念上，自2006年(nian)起，連續三年(nian)獲得教(jiao)(jiao)(jiao)育(yu)部教(jiao)(jiao)(jiao)學(xue)(xue)卓越(yue)計劃補助，獲得肯定(ding)。為落實該(gai)校(xiao)結合醫(yi)學(xue)(xue)科技與(yu)人(ren)文(wen)教(jiao)(jiao)(jiao)育(yu)的(de)理(li)想，深(shen)化人(ren)文(wen)與(yu)通(tong)識(shi)教(jiao)(jiao)(jiao)育(yu)，學(xue)(xue)校(xiao)以(yi)專(zhuan)業教(jiao)(jiao)(jiao)育(yu)通(tong)識(shi)化、通(tong)識(shi)教(jiao)(jiao)(jiao)育(yu)專(zhuan)業化為兩大主軸，持(chi)續貫徹教(jiao)(jiao)(jiao)學(xue)(xue)品質與(yu)績效的(de)目標。
在研(yan)究(jiu)(jiu)方面，頂尖研(yan)究(jiu)(jiu)是國際(ji)一流大(da)(da)學(xue)不可或缺之一環，臺北醫學(xue)大(da)(da)學(xue)過去幾年來，研(yan)究(jiu)(jiu)水準已(yi)有長(chang)足的(de)進步。為(wei)持續朝向世(shi)界前五(wu)百大(da)(da)頂尖大(da)(da)學(xue)，學(xue)校順應國際(ji)趨勢，極(ji)力爭(zheng)取(qu)大(da)(da)型及整合型研(yan)究(jiu)(jiu)計(ji)劃，延攬國內(nei)外杰出人才及其團(tuan)隊，提高研(yan)究(jiu)(jiu)獎勵，并建立(li)與國際(ji)一流研(yan)究(jiu)(jiu)單位合作關系。
在(zai)醫(yi)(yi)療(liao)方面，隨著教(jiao)學(xue)研究(jiu)的(de)成長，該(gai)校醫(yi)(yi)療(liao)體(ti)系也日漸茁壯。臺北(bei)醫(yi)(yi)學(xue)大學(xue)擁有(you)附(fu)(fu)設醫(yi)(yi)院(yuan)(yuan)、萬芳醫(yi)(yi)院(yuan)(yuan)、雙和醫(yi)(yi)院(yuan)(yuan)，三(san)(san)所附(fu)(fu)屬醫(yi)(yi)院(yuan)(yuan)，近三(san)(san)千床之(zhi)規模，是為臺北(bei)地(di)區醫(yi)(yi)學(xue)院(yuan)(yuan)校最大之(zhi)醫(yi)(yi)療(liao)體(ti)系。臺北(bei)醫(yi)(yi)學(xue)大學(xue)統合學(xue)校及三(san)(san)附(fu)(fu)屬醫(yi)(yi)院(yuan)(yuan)的(de)資源，在(zai)見(jian)、實習與臨床技能(neng)訓練上，具有(you)完整的(de)設備與空間，更以(yi)服務鄰近社(she)區，保障國(guo)人健(jian)康為職(zhi)志(zhi)。
洪奇昌：民(min)主進步黨立法委員
林益世：國民黨立法委員
侯文詠：麻醉醫師(shi)、知名(ming)作家
張洪(hong)量(liang)：牙醫(yi)系畢業(ye)，流行音樂歌手(shou)、制作人
隆中(zhong)隱：知(zhi)名中(zhong)國音(yin)樂教育者(zhe)
陳以生(sheng)：牙醫系學士、口研所碩士，流(liu)行(xing)音(yin)樂歌(ge)手(shou)
陳子忠：醫技系學士、中港臺醫療管理人員(yuan)
李良雄：臺北(bei)榮(rong)民總醫院院長
1958年(nian)，創辦人胡水旺先(xian)(xian)生、徐千(qian)田(tian)先(xian)(xian)生籌(chou)設北(bei)醫。
1960年(nian)，北醫創立，當時有醫學系(xi)、牙(ya)醫學系(xi)及藥學系(xi)三系(xi)。
1963年，成立護理助產專修科(ke)，招收五專生。
1965年(nian)，成(cheng)立醫(yi)事技術(shu)專修科，招收五(wu)專生。
1975年，醫(yi)事技術(shu)專修科改(gai)制為醫(yi)事技術(shu)學系(xi)。
1976年，設立臺北醫學(xue)大學(xue)附(fu)設醫院。
1977年，護理(li)助(zhu)產專修科改制為護理(li)學系(xi)。
1979年，成立保健營(ying)養學系。
1989年，成立公共衛生學系。
1989年，成立(li)天然物(wu)醫學研究所。
1990年，胡(hu)俊弘先生(sheng)接(jie)任(ren)校長(chang)，成(cheng)立(li)醫學研(yan)究所。
1992年，成立口腔復健醫學研究(jiu)所。
1993年，口腔復健醫(yi)學研(yan)(yan)究(jiu)所(suo)改名為(wei)牙醫(yi)學研(yan)(yan)究(jiu)所(suo)。天然物醫(yi)學研(yan)(yan)究(jiu)所(suo)改名為(wei)醫(yi)學研(yan)(yan)究(jiu)所(suo)。
1994年，成立細(xi)胞及分子生物研究所。領先(xian)全國各校成立「醫學(xue)資訊暨電子計(ji)算機中(zhong)心」。
1995年，成立保健(jian)營養學研(yan)究所(suo)碩士班。護(hu)理學研(yan)究所(suo)碩士班。
1996年，接收臺(tai)北市(shi)政府委托經營市(shi)立萬芳醫院。
1997年，成立醫務(wu)管理學系。
1998年，成立生(sheng)物醫學技(ji)術研究所、醫學資(zi)訊研究所。
1999年(nian)，成立(li)(li)生藥(yao)(yao)技術學(xue)系(xi)，是臺灣第一個中藥(yao)(yao)相關學(xue)系(xi)。由當時(shi)藥(yao)(yao)學(xue)院(yuan)院(yuan)長楊玲玲教(jiao)授(shou)所創立(li)(li),但由於藥(yao)(yao)師(shi)全聯會(hui)的反對,迫使2007年(nian)停(ting)止招生。
2000年，改名(ming)「臺北醫(yi)(yi)學(xue)大學(xue)」，成(cheng)立(li)醫(yi)(yi)務管理研(yan)(yan)究(jiu)所、生物醫(yi)(yi)學(xue)材(cai)料研(yan)(yan)究(jiu)所。
2001年(nian)，成立(li)呼吸治療學系、口(kou)腔(qiang)衛(wei)生學系。
2002年，成立(li)藥(yao)理學(xue)研(yan)究(jiu)(jiu)所、口腔科學(xue)研(yan)究(jiu)(jiu)所、保健營養研(yan)究(jiu)(jiu)所博(bo)士班。
2003年，通(tong)過(guo)衛生署(shu)甄選，籌建雙和(he)醫院，并(bing)成立醫學人文(wen)研究(jiu)所。
2004年，成立神經科學研(yan)究所。
2006年，口(kou)腔(qiang)科學(xue)(xue)研(yan)究所(suo)(suo)與(yu)生(sheng)醫材料研(yan)究所(suo)(suo)合(he)并(bing)，改名為生(sheng)醫材料暨工程研(yan)究所(suo)(suo)。護理學(xue)(xue)研(yan)究所(suo)(suo)博士(shi)班成立、醫事技(ji)術(shu)學(xue)(xue)系(xi)改名為醫學(xue)(xue)檢驗暨生(sheng)物技(ji)術(shu)學(xue)(xue)系(xi)。
2007年(nian)，成立(li)牙體技術(shu)學(xue)(xue)(xue)系、老(lao)人護(hu)理(li)(li)暨管理(li)(li)學(xue)(xue)(xue)系。由原先的醫學(xue)(xue)(xue)研(yan)究所(suo)(suo)基礎組、細胞及(ji)分(fen)子生(sheng)物研(yan)究所(suo)(suo)、醫學(xue)(xue)(xue)檢驗暨生(sheng)物技術(shu)學(xue)(xue)(xue)系碩士班、藥理(li)(li)學(xue)(xue)(xue)研(yan)究所(suo)(suo)及(ji)神經科學(xue)(xue)(xue)研(yan)究所(suo)(suo)五所(suo)(suo)整合為(wei)醫學(xue)(xue)(xue)科學(xue)(xue)(xue)研(yan)究所(suo)(suo)。
2008年，附屬醫院-雙和(he)醫院於(wu)7月(yue)1日開始營運(yun)、邱文達教授接任校長
2009年，醫務管理學(xue)(xue)系(xi)并入公共衛生(sheng)暨營養學(xue)(xue)院，開(kai)始招收碩士班國際學(xue)(xue)生(sheng)。
2010年(nian)，成(cheng)立醫學(xue)科(ke)技(ji)學(xue)院、人(ren)文暨(ji)社(she)會科(ke)學(xue)院。
2011年，榮(rong)獲QS亞洲頂尖(jian)大(da)學前百大(da)。連(lian)續六年獲教育部(bu)補助近4億元(yuan)。
2011年，邱文(wen)達校長(chang)榮陞衛(wei)生署署長(chang)，閻云教授接(jie)任北醫第九(jiu)任校長(chang)。
2013年，老人護理(li)暨(ji)管理(li)學系(xi)更(geng)名為高(gao)齡健康管理(li)學系(xi)。
2014年(nian)，藥學系分設藥學組(zu)、臨床藥學組(zu)。
2015年，成立(li)管(guan)(guan)理學院(yuan)(yuan)，并將(jiang)公(gong)共衛生(sheng)暨營養學院(yuan)(yuan)中的(de)「醫務管(guan)(guan)理學系（學士(shi)班(ban)(ban)、碩(shuo)士(shi)班(ban)(ban)、碩(shuo)士(shi)在(zai)職專班(ban)(ban)）」整并至管(guan)(guan)理學院(yuan)(yuan)。
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