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同治七年十一月三十日（1869年1月12日），章太炎出(chu)生于一個(ge)地主家庭。章太炎起(qi)初跟從外祖(zu)(zu)父朱(zhu)有虔（左(zuo)卿）學習(xi)，自稱：“余(yu)十一歲時，外祖(zu)(zu)朱(zhu)左(zuo)卿授余(yu)讀(du)經，偶讀(du)蔣氏《東華錄(lu)》曾靜案，外祖(zu)(zu)謂(wei)：‘夷夏之(zhi)防，同于君臣之(zhi)義。’余(yu)問：‘前人有談此(ci)(ci)(ci)語否(fou)？’外祖(zu)(zu)曰(yue)：‘王(wang)船山、顧亭林已言(yan)(yan)之(zhi)，尤以王(wang)氏之(zhi)言(yan)(yan)為甚。謂(wei)‘歷(li)代亡(wang)(wang)國，無足(zu)輕(qing)重，惟南宋之(zhi)亡(wang)(wang)，則衣冠文物(wu)，亦與之(zhi)俱亡(wang)(wang)。’余(yu)曰(yue)：‘明亡(wang)(wang)于清，反不如亡(wang)(wang)于李闖(chuang)(chuang)。’外祖(zu)(zu)曰(yue)：‘今不必(bi)作(zuo)此(ci)(ci)(ci)論，若果李闖(chuang)(chuang)得明天下，闖(chuang)(chuang)雖不善，其子(zi)孫未必(bi)皆不善，惟今不必(bi)作(zuo)此(ci)(ci)(ci)論耳。’余(yu)之(zhi)革命思想(xiang)伏(fu)根于此(ci)(ci)(ci)。”
光緒(xu)十六年（1890年），章太炎(yan)(yan)到杭州詁(gu)經(jing)精(jing)舍學習(xi)，詁(gu)經(jing)精(jing)舍的(de)主持人是俞樾(yue)，俞樾(yue)是從顧炎(yan)(yan)武、戴震、王(wang)念孫、王(wang)引之等一脈相(xiang)承下(xia)來的(de)清代著名樸學大師，撰(zhuan)有《群經(jing)平(ping)(ping)議(yi)》、《諸子(zi)平(ping)(ping)議(yi)》、《古書疑義舉例》，校(xiao)正群經(jing)，諸子(zi)句讀(du)，審定文(wen)義，并(bing)分析其特殊文(wen)法(fa)(fa)與修(xiu)辭，治學方法(fa)(fa)縝密，章太炎(yan)(yan)受其影響，埋頭研究學問，前后(hou)一共有八年之久，期間章太炎(yan)(yan)收獲頗大。
光(guang)緒(xu)二(er)十(shi)(shi)年(nian)(nian)(nian)（1894年(nian)(nian)(nian)），中日(ri)甲午戰(zhan)爭(zheng)中中國被(bei)日(ri)本侵略(lve)者(zhe)打敗(bai)，在(zai)民(min)族(zu)危機深重的(de)(de)(de)(de)刺激(ji)下，章(zhang)(zhang)太(tai)炎毅然走出書(shu)齋，聽到康有(you)為(wei)設立強學(xue)會(hui)(hui)，“寄會(hui)(hui)費銀十(shi)(shi)六圓入會(hui)(hui)”。并于(yu)光(guang)緒(xu)二(er)十(shi)(shi)二(er)年(nian)(nian)(nian)（1896年(nian)(nian)(nian)）年(nian)(nian)(nian)末辭(ci)別俞樾，來到上海，擔任《時(shi)(shi)務(wu)報(bao)》編務(wu)。章(zhang)(zhang)太(tai)炎當時(shi)(shi)的(de)(de)(de)(de)辦(ban)報(bao)主(zhu)張是“馳騁百家”，“引古鑒今(jin)”，“證今(jin)則不(bu)(bu)(bu)為(wei)巵言，陳古則不(bu)(bu)(bu)觸時(shi)(shi)忌”。他(ta)(ta)(ta)在(zai)《時(shi)(shi)務(wu)報(bao)》任職不(bu)(bu)(bu)久，文章(zhang)(zhang)也(ye)只發(fa)表《論(lun)亞洲(zhou)宜自為(wei)唇齒》和(he)《論(lun)學(xue)會(hui)(hui)有(you)大益于(yu)黃人(ren)亟宜保護》兩篇。他(ta)(ta)(ta)認為(wei)凡是西方資(zi)本主(zhu)義(yi)國家的(de)(de)(de)(de)長技，都可(ke)以被(bei)中國所借鑒，并且(qie)可(ke)以作為(wei)改變成法的(de)(de)(de)(de)參考，例如(ru)舉(ju)辦(ban)“有(you)益于(yu)黃人(ren)”的(de)(de)(de)(de)學(xue)會(hui)(hui)。應(ying)該(gai)“修內(nei)政”，行(xing)“新(xin)制(zhi)度(du)”，不(bu)(bu)(bu)能“惟舊章(zhang)(zhang)之(zhi)守”，而(er)(er)須“發(fa)憤(fen)為(wei)天(tian)下雄”。他(ta)(ta)(ta)認為(wei)“變郊(jiao)號，柴社稷，謂(wei)之(zhi)革(ge)(ge)命；禮秀民(min)，聚(ju)俊才(cai)，謂(wei)之(zhi)革(ge)(ge)政。”在(zai)當時(shi)(shi)的(de)(de)(de)(de)社會(hui)(hui)條件下，應(ying)該(gai)“以革(ge)(ge)政挽革(ge)(ge)命”，亦即(ji)實施政治改革(ge)(ge)。與此同時(shi)(shi)，章(zhang)(zhang)太(tai)炎又編撰《經(jing)世報(bao)》、《實學(xue)報(bao)》和(he)《譯書(shu)公會(hui)(hui)報(bao)》。還于(yu)光(guang)緒(xu)二(er)十(shi)(shi)四年(nian)(nian)(nian)（1898年(nian)(nian)(nian)）上書(shu)李鴻章(zhang)(zhang)，企求他(ta)(ta)(ta)能把(ba)握世界的(de)(de)(de)(de)潮流(liu)實行(xing)改革(ge)(ge)。也(ye)曾(ceng)跑到武昌(chang)，幫助張之(zhi)洞辦(ban)《正學(xue)報(bao)》，幻(huan)想借助他(ta)(ta)(ta)的(de)(de)(de)(de)實力推(tui)(tui)動(dong)維(wei)新(xin)變法。不(bu)(bu)(bu)久，維(wei)新(xin)派推(tui)(tui)動(dong)的(de)(de)(de)(de)百日(ri)維(wei)新(xin)夭(yao)折，章(zhang)(zhang)太(tai)炎避地臺灣。他(ta)(ta)(ta)對戊戌六君子的(de)(de)(de)(de)慘遭(zao)殺戮深表憤(fen)慨；對康有(you)為(wei)“內(nei)不(bu)(bu)(bu)容于(yu)讒(chan)構(gou)”而(er)(er)“見詆于(yu)俗儒(ru)鄉(xiang)愿(yuan)者(zhe)”為(wei)之(zhi)解(jie)脫；對以慈(ci)禧太(tai)后(hou)為(wei)首的(de)(de)(de)(de)頑固派的(de)(de)(de)(de)專制(zhi)驕(jiao)橫(heng)極為(wei)仇恨，“討之(zhi)猶(you)可(ke)，況數(shu)其罪乎？”經(jing)歷維(wei)新(xin)新(xin)政的(de)(de)(de)(de)破(po)滅，他(ta)(ta)(ta)的(de)(de)(de)(de)“革(ge)(ge)政”思(si)想較前又有(you)發(fa)展。
光緒二(er)十五年（1899年）夏天，章太炎(yan)東(dong)渡(du)日(ri)本(ben)，在(zai)京(jing)都、東(dong)京(jing)等地為反清做準備(bei)，并與梁啟超(chao)(chao)等人修好，之后返(fan)回上海(hai)參與《亞(ya)東(dong)時(shi)報》編務工作。此時(shi)章太炎(yan)的排滿觀和古文經立場日(ri)益明(ming)確，在(zai)蘇(su)州出版了其著作《訄書》的第(di)一版，由梁啟超(chao)(chao)題簽。
光(guang)緒二(er)十(shi)六年（1900年），義和團運(yun)動(dong)爆發(fa)，八國聯軍(jun)侵(qin)華等(deng)相繼發(fa)生，慈禧太(tai)后等(deng)頑固派的(de)(de)賣國原形暴(bao)露(lu)無遺，章太(tai)炎(yan)受(shou)到極(ji)大震(zhen)動(dong)，從維(wei)新夢中(zhong)醒來。7月，在上海召開的(de)(de)中(zhong)國議會上，他激烈(lie)反(fan)對改(gai)(gai)良(liang)(liang)派提(ti)出的(de)(de)“一面排滿(man)，一面勤(qin)王”的(de)(de)模糊口(kou)號，“宣言(yan)脫社，割辮與(yu)絕(jue)”，撰《解(jie)辮發(fa)》以明志。對過(guo)去設想的(de)(de)“客(ke)帝”、“分(fen)鎮”也進行了糾正，說是“余自戊、己違難，與(yu)尊清者游(you)而(er)作《客(ke)帝》，飾茍且之(zhi)心，棄本崇教，其(qi)違于(yu)形勢遠矣”。進而(er)提(ti)出：“滿(man)洲弗逐，欲士(shi)之(zhi)愛(ai)國，民(min)之(zhi)敵愾，不可得也。浸微浸削，亦終為歐、美之(zhi)陪隸已矣。”接著，章太(tai)炎(yan)樹起反(fan)清的(de)(de)旗幟，開始(shi)向改(gai)(gai)良(liang)(liang)派展開斗爭(zheng)。光(guang)緒二(er)十(shi)七年（1901年），章太(tai)炎(yan)在東京《國民(min)報》發(fa)表《正仇滿(man)論》，尖銳批判(pan)梁(liang)啟(qi)超：“梁(liang)子(zi)所(suo)(suo)悲痛者，革命耳(er)(er)；所(suo)(suo)悲痛于(yu)革命，而(er)思以憲(xian)法易之(zhi)者，為其(qi)圣明之(zhi)主耳(er)(er)。”
光緒二十八(ba)年正月(yue)（1902年2月(yue)），章太炎再次被追捕(bu)，流亡日(ri)本(ben)。初住橫(heng)濱，后入東京，和孫(sun)中山(shan)結識，他(ta)們共同商討推翻(fan)清朝(chao)之(zhi)后的典章制(zhi)度和中國的土地賦稅以至(zhi)建都問題，《訄(qiu)書(shu)》重(zhong)印本(ben)《相宅》和《定版籍》中，就記錄了他(ta)倆當(dang)時的討論情(qing)況。6月(yue)，章太炎返回祖國，為(wei)上海廣智書(shu)局修改他(ta)的譯文，曾譯述(shu)日(ri)本(ben)岸本(ben)能(neng)武太所著(zhu)《社會學(xue)》。他(ta)還(huan)修改了《訄(qiu)書(shu)》，并立(li)下了編修《中國通史(shi)》的志(zhi)向(xiang)，認為(wei)“所貴乎通史(shi)者，固有二方(fang)面：一方(fang)以發明社會政治(zhi)進化衰微(wei)之(zhi)原理為(wei)主(zhu)，則于(yu)典志(zhi)見(jian)之(zhi)；一方(fang)以鼓舞民氣，啟導(dao)方(fang)來為(wei)主(zhu)，則亦必于(yu)紀傳見(jian)之(zhi)”。
光(guang)緒二十九年(nian)二月（1903年(nian)3月），章太(tai)炎到(dao)中國(guo)(guo)教育會贊(zan)助成立(li)的(de)上(shang)海愛國(guo)(guo)社任教。這時，抗法(fa)拒俄運動展開(kai)，革(ge)命(ming)(ming)(ming)形勢發(fa)展，而康(kang)(kang)有(you)為卻(que)發(fa)表了《與同(tong)學諸(zhu)子梁啟超等論(lun)印度亡(wang)國(guo)(guo)由于(yu)(yu)各(ge)省(sheng)自立(li)書(shu)》和《答南北美洲諸(zhu)華商論(lun)中國(guo)(guo)只(zhi)可行(xing)立(li)憲(xian)不(bu)可行(xing)革(ge)命(ming)(ming)(ming)書(shu)》，反對(dui)革(ge)命(ming)(ming)(ming)黨公(gong)開(kai)攻擊滿族統治(zhi)者，以(yi)為立(li)憲(xian)可以(yi)避免革(ge)命(ming)(ming)(ming)造成的(de)慘劇，鼓吹光(guang)緒帝(di)復辟。章太(tai)炎看到(dao)后，公(gong)開(kai)批駁康(kang)(kang)有(you)為，指出康(kang)(kang)有(you)為所謂的(de)“滿漢不(bu)分，君民(min)同(tong)治(zhi)”，實際(ji)上(shang)是(shi)(shi)“屈心忍志以(yi)處奴隸(li)之(zhi)(zhi)(zhi)(zhi)地”。光(guang)緒帝(di)只(zhi)是(shi)(shi)“未辨菽(shu)麥”的(de)“小丑”，他(ta)當初贊(zan)成變法(fa)，不(bu)過(guo)是(shi)(shi)“保吾權(quan)位(wei)”，如(ru)果一旦復辟，必然將中國(guo)(guo)引向(xiang)滅亡(wang)。章太(tai)炎贊(zan)美革(ge)命(ming)(ming)(ming)：“公(gong)理之(zhi)(zhi)(zhi)(zhi)未明，即以(yi)革(ge)命(ming)(ming)(ming)明之(zhi)(zhi)(zhi)(zhi)；舊俗(su)之(zhi)(zhi)(zhi)(zhi)俱在，即以(yi)革(ge)命(ming)(ming)(ming)去(qu)之(zhi)(zhi)(zhi)(zhi)。革(ge)命(ming)(ming)(ming)非天雄、大(da)黃之(zhi)(zhi)(zhi)(zhi)猛劑，而實補(bu)瀉兼備之(zhi)(zhi)(zhi)(zhi)良藥矣(yi)。”他(ta)又為鄒(zou)容(rong)《革(ge)命(ming)(ming)(ming)軍》撰序，說(shuo)是(shi)(shi)“夫(fu)中國(guo)(guo)吞(tun)噬于(yu)(yu)逆胡二百六十年(nian)矣(yi)，宰(zai)割之(zhi)(zhi)(zhi)(zhi)酷(ku)，詐暴(bao)之(zhi)(zhi)(zhi)(zhi)工，人人所身受，當無不(bu)昌言革(ge)命(ming)(ming)(ming)”。
光緒三十二(er)年（1906年）6月29日，章太炎出(chu)獄，中(zhong)國(guo)(guo)同(tong)盟(meng)(meng)會(hui)(hui)派員至(zhi)滬(hu)迎章太炎赴日。他(ta)(ta)在(zai)日本加入中(zhong)國(guo)(guo)同(tong)盟(meng)(meng)會(hui)(hui)，主編中(zhong)國(guo)(guo)同(tong)盟(meng)(meng)會(hui)(hui)機關(guan)報(bao)《民(min)(min)(min)報(bao)》。他(ta)(ta)在(zai)東京留學生歡(huan)迎會(hui)(hui)上發表(biao)(biao)演說(shuo)，述“平生的(de)歷史與近(jin)(jin)日辦事(shi)(shi)的(de)方法”，認為(wei)最緊要(yao)的(de)是(shi)：“第一，是(shi)用宗教(jiao)發起(qi)信(xin)心(xin)，增進(jin)國(guo)(guo)民(min)(min)(min)的(de)道德；第二(er)，是(shi)用國(guo)(guo)粹激(ji)動種性(xing)，增進(jin)愛(ai)國(guo)(guo)的(de)熱(re)腸。”他(ta)(ta)說(shuo)：“近(jin)(jin)來有(you)(you)一種歐化(hua)主義的(de)人，總說(shuo)中(zhong)國(guo)(guo)人比西洋人所差甚遠，所以自甘暴棄，說(shuo)中(zhong)國(guo)(guo)必定(ding)滅亡，黃種必定(ding)剿絕。因為(wei)他(ta)(ta)不(bu)曉得中(zhong)國(guo)(guo)的(de)長(chang)處，見(jian)得別(bie)無可(ke)愛(ai)，就把愛(ai)國(guo)(guo)愛(ai)種之心(xin)，一日衰薄一日。若(ruo)他(ta)(ta)曉得，我想就是(shi)全無心(xin)肝的(de)人，那愛(ai)國(guo)(guo)愛(ai)種之心(xin)，必定(ding)風發泉涌，不(bu)可(ke)遏(e)抑的(de)。”認為(wei)“古事(shi)(shi)古跡，都可(ke)以動人愛(ai)國(guo)(guo)的(de)心(xin)思(si)”。章太炎在(zai)《民(min)(min)(min)報(bao)》上發表(biao)(biao)了不(bu)少政(zheng)論，基本上是(shi)宣揚同(tong)盟(meng)(meng)會(hui)(hui)的(de)革(ge)命綱(gang)領的(de)。在(zai)《民(min)(min)(min)報(bao)一周年紀念(nian)會(hui)(hui)祝(zhu)辭》中(zhong)強調(diao)：“掃(sao)除(chu)腥羶(shan)，建立(li)民(min)(min)(min)國(guo)(guo)。”《民(min)(min)(min)報(bao)一周年紀念(nian)會(hui)(hui)演說(shuo)辭》說(shuo)：“革(ge)命大事(shi)(shi)，不(bu)怕不(bu)成；中(zhong)華民(min)(min)(min)國(guo)(guo)，不(bu)怕不(bu)立(li)。”由章太炎手撰，以“軍政(zheng)府”名義發表(biao)(biao)的(de)《討滿洲(zhou)檄》，更明(ming)確指出(chu)：“自盟(meng)(meng)而后(hou)，為(wei)掃(sao)除(chu)韃(da)虜(lu)，恢復(fu)中(zhong)華，建立(li)民(min)(min)(min)國(guo)(guo)，平均地權。有(you)(you)諭(yu)此盟(meng)(meng)，四(si)萬(wan)萬(wan)人共擊之。”
章(zhang)太(tai)炎在(zai)(zai)論文(wen)中強調革(ge)(ge)命黨自身的建設(she)，認(ren)為“優(you)于(yu)私德者(zhe)(zhe)亦(yi)必(bi)優(you)于(yu)公德，薄(bo)于(yu)私德者(zhe)(zhe)亦(yi)必(bi)薄(bo)于(yu)公德。而(er)無道德者(zhe)(zhe)之(zhi)(zhi)(zhi)(zhi)(zhi)不能革(ge)(ge)命，較然(ran)明矣”。指出革(ge)(ge)命者(zhe)(zhe)必(bi)須(xu)“確固堅厲，重然(ran)諾，輕死生(sheng)”，應該做到“知(zhi)恥”、“重厚”、“耿介”、“必(bi)信”，要(yao)有“革(ge)(ge)命之(zhi)(zhi)(zhi)(zhi)(zhi)道德”。章(zhang)太(tai)炎在(zai)(zai)論文(wen)中深(shen)刻揭(jie)露改良派“競名死利(li)”、“志(zhi)在(zai)(zai)千(qian)祿”的丑(chou)態。并說：“夫其所操技術，豈謂(wei)上(shang)足(zu)(zu)以(yi)(yi)(yi)(yi)給(gei)當世之(zhi)(zhi)(zhi)(zhi)(zhi)用，下(xia)足(zu)(zu)以(yi)(yi)(yi)(yi)成(cheng)一家之(zhi)(zhi)(zhi)(zhi)(zhi)言耶？汗漫之(zhi)(zhi)(zhi)(zhi)(zhi)策論，不可(ke)(ke)以(yi)(yi)(yi)(yi)為成(cheng)文(wen)之(zhi)(zhi)(zhi)(zhi)(zhi)法；雜博之(zhi)(zhi)(zhi)(zhi)(zhi)記誦，不可(ke)(ke)以(yi)(yi)(yi)(yi)當說經之(zhi)(zhi)(zhi)(zhi)(zhi)詁；單篇之(zhi)(zhi)(zhi)(zhi)(zhi)文(wen)筆，不可(ke)(ke)以(yi)(yi)(yi)(yi)承(cheng)儒、墨之(zhi)(zhi)(zhi)(zhi)(zhi)流；匿采之(zhi)(zhi)(zhi)(zhi)(zhi)華辭，不可(ke)(ke)以(yi)(yi)(yi)(yi)備(bei)瞽蒙之(zhi)(zhi)(zhi)(zhi)(zhi)頌；淫哇之(zhi)(zhi)(zhi)(zhi)(zhi)賦詠，不可(ke)(ke)以(yi)(yi)(yi)(yi)瞻國政(zheng)之(zhi)(zhi)(zhi)(zhi)(zhi)違(wei)。既失其末，而(er)又不得(de)(de)其本，視(shi)經方陶冶之(zhi)(zhi)(zhi)(zhi)(zhi)流，猶尚弗(fu)及，亦(yi)曰以(yi)(yi)(yi)(yi)是嘩(hua)世取寵而(er)已”，指出改良派的“謀立憲”，只能使“豪民(min)(min)得(de)(de)志(zhi)，苞(bao)苴(ju)橫流，朝有黨援，吏依門戶，士習囂(xiao)競，民(min)(min)苦騷煩”，表示堅決反對。他還(huan)在(zai)(zai)《民(min)(min)報(bao)》上(shang)刊發別人(ren)批(pi)駁《新民(min)(min)叢(cong)報(bao)》的文(wen)章(zhang)。章(zhang)太(tai)炎在(zai)(zai)《民(min)(min)報(bao)》上(shang)發表的文(wen)章(zhang)，大都(dou)針鋒相(xiang)對，文(wen)字銳利(li)，“真是所向披靡，令人(ren)神旺”。
自光(guang)(guang)緒三十(shi)一(yi)年(nian)（1905年(nian)）起，章太炎(yan)在(zai)《國(guo)(guo)粹學(xue)(xue)(xue)(xue)(xue)報》上發(fa)表(biao)若(ruo)干(gan)學(xue)(xue)(xue)(xue)(xue)術(shu)文字(zi)(zi)，并(bing)在(zai)東京(jing)開(kai)設國(guo)(guo)學(xue)(xue)(xue)(xue)(xue)講習班，“宏獎光(guang)(guang)復，不廢(fei)講學(xue)(xue)(xue)(xue)(xue)”。此前，光(guang)(guang)緒二十(shi)九年(nian)（1903年(nian)），章太炎(yan)與近(jin)代古文經學(xue)(xue)(xue)(xue)(xue)另一(yi)重鎮(zhen)劉(liu)師(shi)培定交(jiao)，此后因學(xue)(xue)(xue)(xue)(xue)術(shu)祈向相(xiang)近(jin)而(er)交(jiao)往日密(mi)，遂發(fa)生(sheng)被劉(liu)師(shi)培與妻子何震誣蔑叛變事件。又與孫中(zhong)山(shan)、汪精衛、黃興等(deng)(deng)因《民報》不合，乃由提倡光(guang)(guang)復轉入專心論學(xue)(xue)(xue)(xue)(xue)，著有(you)(you)《文始》《新方言》《國(guo)(guo)故論衡(heng)》《齊物(wu)論釋》等(deng)(deng)。其中(zhong)《國(guo)(guo)故論衡(heng)》為近(jin)代學(xue)(xue)(xue)(xue)(xue)術(shu)史上有(you)(you)數(shu)之巨制，開(kai)辟了漢(han)語言文字(zi)(zi)學(xue)(xue)(xue)(xue)(xue)、經學(xue)(xue)(xue)(xue)(xue)、文學(xue)(xue)(xue)(xue)(xue)及(ji)哲學(xue)(xue)(xue)(xue)(xue)、心理學(xue)(xue)(xue)(xue)(xue)的現代化研究(jiu)的先河。宣統元年(nian)（1909年(nian)）又編有(you)(you)《教育今語雜(za)志》，撰寫若(ruo)干(gan)白話述學(xue)(xue)(xue)(xue)(xue)著作，以普及(ji)學(xue)(xue)(xue)(xue)(xue)術(shu)。
宣(xuan)統三(san)年（1911年），武昌起(qi)義勝利之后，章(zhang)(zhang)太(tai)炎(yan)提出了“革命軍(jun)起(qi)，革命黨(dang)(dang)消”的(de)錯(cuo)誤口號，主(zhu)張解散同盟會(hui)，并和一些立憲黨(dang)(dang)人在一起(qi)，組織中華(hua)民國(guo)(guo)(guo)聯合會(hui)。民國(guo)(guo)(guo)元年（1912年）1月1日(ri)，孫中山在南京(jing)就任中華(hua)民國(guo)(guo)(guo)臨時大總統，聘任章(zhang)(zhang)太(tai)炎(yan)為總統府樞密顧問(wen)，他(ta)不(bu)愿常駐南京(jing)，返回(hui)上(shang)海。2月中旬，在討論建都問(wen)題時，章(zhang)(zhang)太(tai)炎(yan)主(zhu)張建都北(bei)京(jing)，認為“中國(guo)(guo)(guo)本因舊(jiu)(jiu)之國(guo)(guo)(guo)，非新辟之國(guo)(guo)(guo)，其(qi)良法美(mei)俗，應保存者則存留之，不(bu)能事事更張也”。他(ta)依(yi)戀(lian)舊(jiu)(jiu)制(zhi)度，說“專(zhuan)制(zhi)非無良規，共和非無粃(bi)政”，“政治(zhi)法律，皆依(yi)習慣而(er)成”，主(zhu)張中央“特(te)建都察院”，“限(xian)(xian)制(zhi)元首”，地方(fang)“廢省存道”，而(er)對代議民主(zhu)制(zhi)則表示反對，主(zhu)張“限(xian)(xian)制(zhi)財產”，又(you)以(yi)(yi)“奪(duo)富者之田以(yi)(yi)與貧民”為“大悖乎理”。
南北(bei)議(yi)和(he)告成，袁世凱上臺，章太炎幻想袁世凱“厲(li)精法治”，“以(yi)(yi)厝中(zhong)夏于泰山磐石(shi)之安”。在用(yong)(yong)人問題上，以(yi)(yi)為“同(tong)盟(meng)會人材乏絕，清流(liu)不歸”。反對(dui)“政黨內閣”，提出(chu)“取(qu)清時南方督撫有(you)材名(ming)者以(yi)(yi)充閣員之選”。說什么：“漢之良相，即(ji)亡秦之退官；唐之名(ming)臣，即(ji)敗隋(sui)之故吏。”主張“循舊(jiu)貫”，用(yong)(yong)“老吏”。將中(zhong)華民國聯合(he)會與(yu)一些小(xiao)政團(tuan)合(he)并，改組為統一黨，以(yi)(yi)后更與(yu)民社等并為共和(he)黨，推黎元洪(hong)為理事(shi)長。
袁世凱給了(le)章(zhang)太炎一個總統府高(gao)等顧問(wen)的空銜，不(bu)(bu)(bu)久又委(wei)任(ren)為(wei)(wei)東三(san)省(sheng)(sheng)籌邊(bian)使(shi)，調出北京。章(zhang)太炎興致(zhi)勃(bo)勃(bo)地跑(pao)到東北去“興辦實(shi)業(ye)”，設(she)東三(san)省(sheng)(sheng)籌邊(bian)使(shi)署于(yu)長春，擬《東三(san)省(sheng)(sheng)實(shi)業(ye)計劃書(shu)》，提(ti)(ti)出“設(she)立三(san)省(sheng)(sheng)銀行，以(yi)圓易吊，使(shi)民易知”，并鑄(zhu)造(zao)金(jin)幣。“欲(yu)鑄(zhu)金(jin)幣，又不(bu)(bu)(bu)可不(bu)(bu)(bu)預浚金(jin)源，非(fei)開辦金(jin)礦，收買金(jin)砂，不(bu)(bu)(bu)足(zu)以(yi)供(gong)鼓鑄(zhu)。又請(qing)開浚松花江、遼河，去其(qi)淤梗，以(yi)利交(jiao)通(tong)”。還擬“組織報(bao)館”，“設(she)會研究”。但沒(mei)有多(duo)久，宋教(jiao)仁遇刺，血(xue)的教(jiao)訓使(shi)他(ta)(ta)(ta)猛(meng)醒過來，他(ta)(ta)(ta)沉(chen)痛地《挽宋教(jiao)仁》：“愿君化彗孛；為(wei)(wei)我掃幽燕”，開始對(dui)袁世凱不(bu)(bu)(bu)信任(ren)了(le)。4月(yue)，章(zhang)太炎托事南行。5月(yue)，他(ta)(ta)(ta)又親赴武(wu)(wu)昌，拜謁了(le)黎元洪，在湖北致(zhi)電袁世凱，請(qing)求免除梁(liang)士(shi)詒、陳宧、段(duan)芝(zhi)貴、趙(zhao)秉鈞“四兇”的職(zhi)位。接(jie)著，由武(wu)(wu)漢到了(le)北京，袁世凱設(she)法籠絡章(zhang)太炎。5月(yue)25日發令“章(zhang)炳麟授以(yi)勛二(er)位”，“冀以(yi)歆(xin)動”。6月(yue)4日，章(zhang)太炎離京來滬。而他(ta)(ta)(ta)早(zao)先提(ti)(ti)議在東北籌設(she)實(shi)業(ye)銀行的借款，財政部長梁(liang)士(shi)詒不(bu)(bu)(bu)肯蓋章(zhang)，章(zhang)太炎“實(shi)業(ye)計劃”落空，感到“大抵政府之與(yu)我輩，忌疾甚深(shen)，罵亦(yi)阻(zu)撓(nao)，不(bu)(bu)(bu)罵亦(yi)阻(zu)撓(nao)”，于(yu)是決計“辭差(cha)”，“奉身而退”。
民國二年（1913年）4月(yue)(yue)，章太(tai)(tai)炎從長春返回上海。7月(yue)(yue)，孫中(zhong)山、黃興舉兵武力討袁，章太(tai)(tai)炎卻不信賴，說什么“討袁者(zhe)亦非其人(ren)(ren)”。他既(ji)罵袁世凱“用(yong)(yong)心陰摯，正(zheng)與(yu)西太(tai)(tai)后(hou)大同”，又說孫中(zhong)山“與(yu)項(xiang)城一丘之(zhi)(zhi)(zhi)貉”。“謂宜(yi)雙退(tui)袁與(yu)孫、黃，改建賢(xian)哲(zhe)，仆則承(cheng)命”。以(yi)(yi)為(wei)(wei)(wei)“若為(wei)(wei)(wei)久遠計，凡一政(zheng)黨，非有(you)實業為(wei)(wei)(wei)中(zhong)堅(jian)，即有(you)俠士為(wei)(wei)(wei)后(hou)應，無此(ci)即不足以(yi)(yi)自(zi)樹(shu)。非實業則費用(yong)(yong)不給，而政(zheng)府(fu)得以(yi)(yi)利用(yong)(yong)之(zhi)(zhi)(zhi)矣；非俠士則氣勢不壯，而政(zheng)府(fu)得以(yi)(yi)威(wei)喝(he)之(zhi)(zhi)(zhi)矣”。以(yi)(yi)為(wei)(wei)(wei)總統改選，“大抵仍(reng)宜(yi)推舉黃陂，必不肯(ken)任，然后(hou)求(qiu)之(zhi)(zhi)(zhi)西林(lin)”。“黃陂之(zhi)(zhi)(zhi)廉讓(rang)，可望(wang)責任內閣；西林(lin)之(zhi)(zhi)(zhi)果毅，可望(wang)廓清貪邪”。黎元洪（黃陂）也好，岑(cen)春煊(xuan)（西林(lin)）也好，都是(shi)清朝舊官(guan)僚，民國新軍(jun)閥，章太(tai)(tai)炎對這些(xie)人(ren)(ren)寄以(yi)(yi)厚望(wang)，他已彷徨歧途了。
6月，章(zhang)太(tai)炎(yan)與(yu)湯國(guo)梨結婚。8月，章(zhang)太(tai)炎(yan)“冒危入京師”，一(yi)方面看(kan)到“京邑(yi)崎(qi)嶇，道路以目”，以為“吾(wu)雖微末，以一(yi)身攖暴(bao)人之(zhi)刃，使天下皆(jie)曉然(ran)于彼之(zhi)兇戾，亦何(he)惜此孱(chan)形(xing)為”，表示(shi)不(bu)畏強暴(bao)，敢臨虎穴；另一(yi)方面又以為“共和(he)黨勢(shi)漸擴張(zhang)，此為可熹”，“連日議員入黨者(zhe)，已增(zeng)三十(shi)人矣，驥老伏櫪(li)，志在千里，況吾(wu)猶未老耶？”但(dan)是(shi)，袁世凱對章(zhang)太(tai)炎(yan)還(huan)是(shi)不(bu)肯放(fang)松，對他(ta)加緊(jin)迫害(hai)，把(ba)他(ta)軟(ruan)禁起來，梁士(shi)詒、趙(zhao)秉鈞(jun)等還(huan)欲(yu)“捏(nie)造證據，置章(zhang)于死”。
民國三年（1914年）1月，章太炎欲乘(cheng)車離京，為軍警所阻。7日，“以(yi)大勛章作(zuo)扇墜，臨總統府之(zhi)(zhi)門，大詬(gou)袁世凱之(zhi)(zhi)包藏禍心”，仍被(bei)監(jian)禁。曾決意(yi)絕食，“以(yi)死爭(zheng)之(zhi)(zhi)”，自云：“不死于清(qing)廷(ting)購(gou)捕之(zhi)(zhi)時，而死于民國告(gao)成之(zhi)(zhi)后，吾何言哉！”直到(dao)民國五(wu)年（1916年）袁世凱死后，才被(bei)釋放。在監(jian)禁期間，編(bian)成《章氏叢書》初編(bian)。
民國(guo)(guo)五年(nian)（1916年(nian)）6月，章太炎(yan)由(you)北京南返(fan)。這(zhe)時，孫(sun)中(zhong)山(shan)也在(zai)上(shang)海(hai)，曾兩電(dian)黎(li)元(yuan)洪(hong)(hong)規復約(yue)法(fa)，尊重國(guo)(guo)會(hui)；章太炎(yan)也認(ren)為(wei)“約(yue)法(fa)、國(guo)(guo)會(hui)，本民國(guo)(guo)固有之物，為(wei)袁氏所(suo)摧(cui)殘”，主張維護。此(ci)后，他多次和(he)孫(sun)中(zhong)山(shan)一(yi)起參加會(hui)議，基本主張與(yu)孫(sun)中(zhong)山(shan)尚相契(qi)合(he)。8月，章太炎(yan)南赴肇(zhao)慶，去看望岑(cen)春煊，更(geng)出游南洋群島，一(yi)直到年(nian)末(mo)才回國(guo)(guo)。孫(sun)中(zhong)山(shan)致電(dian)黎(li)元(yuan)洪(hong)(hong)，認(ren)為(wei)章太炎(yan)“碩學卓(zhuo)識，不畏強御，古之良史(shi)，無以過之，為(wei)事擇人，竊謂最(zui)當”，推舉章為(wei)國(guo)(guo)史(shi)館長。
民(min)國(guo)六年（1917年）3月，段祺瑞召集(ji)(ji)督軍(jun)(jun)團在(zai)北京(jing)開會(hui)(hui)，商討(tao)對德宣戰(zhan)。5月7日(ri)，國(guo)會(hui)(hui)討(tao)論參(can)戰(zhan)案；10日(ri)，段祺瑞組織“公(gong)民(min)請愿團”等(deng)，包圍(wei)國(guo)會(hui)(hui)，毆辱議員。章(zhang)太炎和孫中山兩次(ci)致電黎元洪，要求嚴懲“偽公(gong)民(min)犯法亂紀之(zhi)(zhi)人(ren)(ren)”，“嚴懲暴徒(tu)主(zhu)(zhu)名”，“勿令(ling)勢(shi)要從旁掣肘”。6月7日(ri)，張勛率軍(jun)(jun)北上，與段派集(ji)(ji)議，電黎“調停(ting)須(xu)先解(jie)散國(guo)會(hui)(hui)”。孫、章(zhang)聯(lian)電陸榮廷等(deng)南方各省督軍(jun)(jun)、省長(chang)，指出：“調停(ting)戰(zhan)事之(zhi)(zhi)人(ren)(ren)，即主(zhu)(zhu)張復辟(pi)之(zhi)(zhi)人(ren)(ren)；擁護元首之(zhi)(zhi)人(ren)(ren)，即主(zhu)(zhu)張廢立之(zhi)(zhi)人(ren)(ren)。”“叛人(ren)(ren)秉政，則共(gong)和遺民(min)必(bi)無噍類(lei)”。又聯(lian)名致電陳炯明：“國(guo)會(hui)(hui)為民(min)國(guo)之(zhi)(zhi)命(ming)脈，調和乃借寇之(zhi)(zhi)資糧”，“今者群(qun)盜鴟張，叛形已(yi)著(zhu)，黃陂與之(zhi)(zhi)講解(jie)，實同降伏”。
7月(yue)(yue)1日，張勛復(fu)辟。3日，章(zhang)太(tai)(tai)炎(yan)與海(hai)軍總長程璧光等在孫中(zhong)(zhong)山(shan)(shan)的(de)(de)住處秘密商議，籌劃反對張勛的(de)(de)復(fu)辟舉(ju)動(dong)。接著，與孫中(zhong)(zhong)山(shan)(shan)、廖仲愷、朱執(zhi)信(xin)、何(he)香凝乘海(hai)琛艦由上海(hai)啟程赴(fu)廣州，于7月(yue)(yue)17日抵粵(yue)(yue)。當有人(ren)詢以討逆計劃時，章(zhang)太(tai)(tai)炎(yan)即答(da)以：“余(yu)此次偕孫中(zhong)(zhong)山(shan)(shan)來粵(yue)(yue)，所(suo)抱之(zhi)希望(wang)頗(po)大”，“討逆之(zhi)舉(ju)，即為(wei)護法(fa)而(er)起(qi)，惟不違法(fa)之(zhi)人(ren)而(er)后(hou)(hou)可以討逆”。永豐、同(tong)(tong)安、豫章(zhang)三艦抵達(da)黃埔(pu)，孫、章(zhang)一起(qi)前(qian)往迎(ying)迓。廣東(dong)各(ge)界開歡(huan)迎(ying)海(hai)軍大會，孫中(zhong)(zhong)山(shan)(shan)、程璧光到會，章(zhang)太(tai)(tai)炎(yan)亦參加。9月(yue)(yue)1日，國民非常(chang)會議選舉(ju)孫中(zhong)(zhong)山(shan)(shan)為(wei)中(zhong)(zhong)華民國軍政(zheng)府(fu)大元帥，章(zhang)太(tai)(tai)炎(yan)任護法(fa)軍政(zheng)府(fu)秘書長，《大元帥就職(zhi)宣(xuan)言(yan)》就是(shi)章(zhang)太(tai)(tai)炎(yan)起(qi)草的(de)(de)。《宣(xuan)言(yan)》中(zhong)(zhong)說：“民國根本，掃(sao)地無余(yu)，猶幸(xing)共和大義，浹于人(ren)心，舉(ju)國同(tong)(tong)聲(sheng)，誓(shi)殲元惡”，誓(shi)“與天下共擊破壞共和者”。此后(hou)(hou)，因護法(fa)軍政(zheng)府(fu)中(zhong)(zhong)派(pai)系斗(dou)爭激烈，章(zhang)“欲西行”，孫中(zhong)(zhong)山(shan)(shan)勸以“不當先去以失人(ren)望(wang)”，章(zhang)太(tai)(tai)炎(yan)表示愿為(wei)軍政(zheng)府(fu)爭取外援，到云(yun)南聯絡唐(tang)繼(ji)(ji)(ji)堯。當他抵達(da)昆(kun)明(ming)后(hou)(hou)，多(duo)次向唐(tang)繼(ji)(ji)(ji)堯進言(yan)，促(cu)唐(tang)繼(ji)(ji)(ji)堯東(dong)下，但唐(tang)繼(ji)(ji)(ji)堯始(shi)終是(shi)托故(gu)不出。
民(min)國(guo)(guo)八年（1919年），五四運(yun)(yun)動爆(bao)發，工人革命運(yun)(yun)動日漸(jian)發展，章(zhang)(zhang)太炎卻由(you)反對(dui)軍(jun)(jun)閥(fa)割(ge)據逐漸(jian)演變(bian)為(wei)贊成軍(jun)(jun)閥(fa)割(ge)據。民(min)國(guo)(guo)九年（1920年）11月，湖南(nan)通電湘省(sheng)自(zi)治(zhi)(zhi)，章(zhang)(zhang)太炎隨(sui)即在北京《益世報》發表(biao)《聯(lian)省(sheng)自(zi)治(zhi)(zhi)虛(xu)置(zhi)(zhi)政(zheng)府(fu)議》，認為(wei)宜虛(xu)置(zhi)(zhi)中(zhong)央政(zheng)府(fu)，軍(jun)(jun)政(zheng)則分于各省(sheng)督軍(jun)(jun)。接(jie)著，又主張使地方權重而中(zhong)央權輕，各省(sheng)自(zi)治(zhi)(zhi)為(wei)第一步(bu)，聯(lian)省(sheng)自(zi)治(zhi)(zhi)為(wei)第二步(bu)，聯(lian)省(sheng)政(zheng)府(fu)為(wei)第三步(bu)，還(huan)必以本(ben)省(sheng)人充軍(jun)(jun)民(min)長官。這種聯(lian)省(sheng)自(zi)治(zhi)(zhi)說，和孫(sun)中(zhong)山的統(tong)一主張背道(dao)而馳。民(min)國(guo)(guo)十年（1921年）5月，孫(sun)中(zhong)山在廣州就任(ren)非(fei)常大總統(tong)職，章(zhang)(zhang)太炎以為(wei)非(fei)法，并以“聯(lian)合自(zi)治(zhi)(zhi)不(bu)可反對(dui)為(wei)獻”。
民(min)國(guo)十二年(nian)（1923年(nian)）1月，孫(sun)中(zhong)山在(zai)上(shang)海(hai)發表(biao)《和平統(tong)一(yi)宣(xuan)言(yan)》，章太炎(yan)(yan)(yan)以(yi)(yi)為“統(tong)一(yi)利害，久(jiu)處南方(fang)者自(zi)知，若謂(wei)借此以(yi)(yi)緩最高問題，則亦非計(ji)”。次年(nian)1月，中(zhong)國(guo)國(guo)民(min)黨(dang)(dang)第一(yi)次全國(guo)代表(biao)大(da)會在(zai)廣州召開，通過了《中(zhong)國(guo)國(guo)民(min)黨(dang)(dang)第一(yi)次全國(guo)代表(biao)大(da)會宣(xuan)言(yan)》，接受了中(zhong)國(guo)共產(chan)黨(dang)(dang)所提出(chu)的(de)反帝反封建的(de)主(zhu)張，分析和批判了當時社會上(shang)流行的(de)各種錯誤的(de)、反動的(de)政治(zhi)流派，包括“聯省自(zi)治(zhi)派”，宣(xuan)告取消不(bu)平等條約；孫(sun)中(zhong)山又(you)系統(tong)講述了三民(min)主(zhu)義(yi)。10日，決定應馮玉(yu)(yu)祥的(de)電邀(yao)，“即日北上(shang)”。章太炎(yan)(yan)(yan)對(dui)改組后(hou)的(de)中(zhong)國(guo)國(guo)民(min)黨(dang)(dang)表(biao)示不(bu)滿，在(zai)國(guo)民(min)黨(dang)(dang)右派馮玉(yu)(yu)祥自(zi)由等的(de)慫(song)恿下，發出(chu)《護黨(dang)(dang)救國(guo)宣(xuan)言(yan)》，“冀以(yi)(yi)同盟舊人，重行集合團體(ti)”。不(bu)久(jiu)，馮玉(yu)(yu)祥自(zi)由組織中(zhong)國(guo)國(guo)民(min)黨(dang)(dang)同志俱樂部，章太炎(yan)(yan)(yan)也組織了辛(xin)亥(hai)革命同志俱樂部，背離(li)孫(sun)中(zhong)山，反對(dui)共產(chan)黨(dang)(dang)。
民國十(shi)四(si)年（1925年），“五卅(sa)運動”發生(sheng)，章太(tai)炎發出《為(wei)(wei)上海英(ying)租界巡捕慘殺(sha)學生(sheng)之通電》。“以為(wei)(wei)英(ying)捕而(er)不(bu)治(zhi)罪，固不(bu)足以肅(su)刑章；英(ying)捕而(er)果(guo)治(zhi)罪，亦未(wei)必(bi)足以防后患。惟有責成外(wai)交當局，迅(xun)速收回(hui)租界市政，庶幾一(yi)勞永逸，民慶再(zai)生(sheng)”。
民(min)國(guo)(guo)十(shi)六年(nian)（1927年(nian)），章(zhang)太炎(yan)賦詩自述：“見說興亡事，拿舟望五(wu)湖”。晚年(nian)在蘇州講學，組織(zhi)國(guo)(guo)學會，欲“甄明學術，發(fa)揚國(guo)(guo)光”。民(min)國(guo)(guo)二(er)(er)十(shi)二(er)(er)年(nian)（1933年(nian)），刻《章(zhang)氏叢書(shu)續(xu)編》于(yu)北(bei)平，所收(shou)不(bu)多，而(er)更純謹，且(qie)不(bu)取舊作，當然也無斗爭之(zhi)作，先生遂(sui)身(shen)衣學術之(zhi)華(hua)袞，粹(cui)然成為儒宗”。但(dan)是，當帝(di)國(guo)(guo)主(zhu)義蹂躪中(zhong)國(guo)(guo)，中(zhong)華(hua)民(min)族(zu)災難深重的時候(hou)，章(zhang)太炎(yan)起(qi)來譴責國(guo)(guo)民(min)黨“怯于(yu)御(yu)亂而(er)勇于(yu)內爭”。民(min)國(guo)(guo)二(er)(er)十(shi)一年(nian)（1932年(nian)），北(bei)上見張(zhang)(zhang)學良；次年(nian)，又與馬相伯等聯合發(fa)表(biao)“二(er)(er)老宣言(yan)”、“三老宣言(yan)”：“對于(yu)當前日本(ben)之(zhi)侵略暴行(xing)，不(bu)僅(jin)作消極(ji)之(zhi)抵抗，同時更應動(dong)員全民(min)族(zu)積極(ji)收(shou)復(fu)失地、根(gen)本(ben)消滅(mie)偽國(guo)(guo)”，呼吁抗日。民(min)國(guo)(guo)二(er)(er)十(shi)四年(nian)（1935年(nian)），一二(er)(er)九(jiu)運動(dong)發(fa)生，宋(song)哲(zhe)元進行(xing)壓制。章(zhang)太炎(yan)致(zhi)電宋(song)哲(zhe)元：“學生請愿，事出公誠，縱有加入共黨者，但(dan)問(wen)今之(zhi)主(zhu)張(zhang)(zhang)何如，何論(lun)其平素(su)。”
12月24日，上海學生(sheng)(sheng)(sheng)北(bei)上請愿，國(guo)民(min)黨加以阻撓，章(zhang)太炎(yan)(yan)(yan)“對(dui)學生(sheng)(sheng)(sheng)愛國(guo)運動(dong)深表(biao)同情。但認政府當局，應善為(wei)處(chu)理(li)，不應貿然加以共產(chan)頭銜，武力制(zhi)止”。請愿學生(sheng)(sheng)(sheng)經(jing)過(guo)蘇州(zhou)時，又“派(pai)代表(biao)慰勞，并囑縣長饋食”。他“瞻(zhan)顧(gu)民(min)族之(zhi)(zhi)前途，輒中心(xin)忉怛而未(wei)能自己(ji)”，臨(lin)終前，在(zai)(zai)《答友人(ren)書》中還說：“北(bei)平既急，縱令勉力支持，察省(sheng)必(bi)難兼顧(gu)。蓋非常(chang)(chang)之(zhi)(zhi)時，必(bi)以非常(chang)(chang)之(zhi)(zhi)事應之(zhi)(zhi)。令共黨之(zhi)(zhi)在(zai)(zai)晉北(bei)者，其(qi)(qi)意不過(guo)欲北(bei)據河套，與(yu)蘇俄通聲勢耳(er)。此(ci)輩雖多狙詐，然其(qi)(qi)對(dui)于日軍，必(bi)不肯俯首馴伏明甚”。盡(jin)管章(zhang)太炎(yan)(yan)(yan)不可能對(dui)共產(chan)黨有(you)真正(zheng)認識，但他對(dui)共產(chan)黨的(de)堅(jian)持抗戰、國(guo)民(min)黨的(de)“不抵抗主(zhu)義(yi)”還是覺察的(de)。盡(jin)管章(zhang)太炎(yan)(yan)(yan)晚(wan)年的(de)行為(wei)也有(you)使人(ren)失望(wang)之(zhi)(zhi)處(chu)，卻仍保持了愛國(guo)主(zhu)義(yi)晚(wan)節。民(min)國(guo)二十五年（1936年）6月14日，章(zhang)太炎(yan)(yan)(yan)病逝。
《章(zhang)氏叢書(shu)》，1915年右文社鉛印本，1919年浙江圖書(shu)館木刻本，1924年上海古書(shu)流通處木刻本。
《章氏叢書續編》，北平1933年。
《章氏叢書三編》，1939年章氏國學講(jiang)習會鉛印本(ben)。
《章太炎全集》1-8集（尚未(wei)出完），上海人(ren)民出版社，1980-94年(nian)點校本。
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《國故論(lun)衡》，1910年東京秀光社本，叢書增訂本。陳平原(yuan)點(dian)校(xiao)(xiao)本，朱(zhu)維錚(zheng)點(dian)校(xiao)(xiao)本（《全集》第9集，對(dui)照本）。
《國(guo)學概論》，曹聚仁筆(bi)記本（又有張冥飛本，劣）。1922年泰(tai)東圖(tu)書館排印本。
《菿漢三言(yan)》，虞云國(guo)校點，遼寧教育出版社。
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《章太炎的白話文》，1921年泰東(dong)圖書館排印本。
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《章太(tai)炎學術年譜(pu)》，姚奠中、董國炎編，山西(xi)古(gu)籍出版社(she)，1993年。
《自述學術(shu)次(ci)第(di)》，學術(shu)自述，1913年。
《菿漢微(wei)言》末條(tiao)，1915年。
諸祖(zu)耿(geng)《記本師章公(gong)自述治(zhi)學之功(gong)夫及志向》，1933年。
《國故論衡疏(shu)證》，龐(pang)俊注，1940年華西大(da)學鉛(qian)印(yin)(yin)本。僅含中、下卷(juan)；郭(guo)誠永(yong)補注上卷(juan)，北京中華書局2008年全排印(yin)(yin)本。
《齊物論釋注(zhu)》，繆篆(zhuan)注(zhu)，油印(yin)本。未見。《齊物論釋訓注(zhu)》，荒木見悟注(zhu)，九州(zhou)大(da)學文學部哲學研(yan)究會(hui)《哲學年報》29-31。未見。
《章太炎選(xuan)集》（注釋(shi)本(ben)），朱維錚、姜義華(hua)注，上海人民出版社，1981年。
《訄書詳注》，徐(xu)復注，上海(hai)古籍(ji)出版(ban)社，2000年。注名(ming)物。
《文(wen)(wen)學總略注》，程千帆《文(wen)(wen)論(lun)十箋》，朱(zhu)東潤《中國歷代(dai)文(wen)(wen)論(lun)選》。
英國斯賓(bin)塞爾(er)（Herbert Spencer）著，曾(ceng)廣銓、章太炎譯《斯賓(bin)塞爾(er)文集》，上海《昌言報》第(di)1至7本，1898年。
日本岸本能武太著、章(zhang)太炎譯(yi)《社(she)會學》，上海廣智書局，1902年鉛印本。
章太炎的主筆有《時務報(bao)(bao)(bao)(bao)》、《昌言(yan)報(bao)(bao)(bao)(bao)》、《經世(shi)報(bao)(bao)(bao)(bao)》、《實學報(bao)(bao)(bao)(bao)》、《譯書公會報(bao)(bao)(bao)(bao)》、《亞東時報(bao)(bao)(bao)(bao)》、《臺灣(wan)日日新報(bao)(bao)(bao)(bao)》、《民報(bao)(bao)(bao)(bao)》、《國粹學報(bao)(bao)(bao)(bao)》、《教(jiao)育(yu)今語雜志(zhi)》、《大共和日報(bao)(bao)(bao)(bao)》、《華國》、《制言(yan)》等。
章氏(shi)的(de)思想受到多方影響，因(yin)為變化(hua)(hua)的(de)歷程(cheng)相(xiang)當繁復(fu)，依其《菿漢(han)微言》中的(de)自述，是以“始則轉(zhuan)俗(su)成(cheng)真，終則回真向俗(su)”十二字予以歸(gui)結。大(da)抵而言可以光緒二十四年(nian)（1908年(nian)）著(zhu)成(cheng)《齊物論釋》為界。在此之前，章氏(shi)先習(xi)樸學(xue)(xue)、諸子學(xue)(xue)以及西方進化(hua)(hua)論和(he)社(she)會(hui)學(xue)(xue)，在因(yin)蘇報案(an)入獄之后，則改習(xi)法(fa)相(xiang)宗，而后思想便以唯識(shi)學(xue)(xue)為尚，認(ren)為先秦諸子之學(xue)(xue)皆不(bu)足比擬，固可謂“轉(zhuan)俗(su)成(cheng)真”。
自《齊物(wu)論釋》著成之(zhi)后，章(zhang)太(tai)炎(yan)因(yin)齊物(wu)思(si)想(xiang)(xiang)的(de)(de)(de)(de)啟示，不再(zai)僅(jin)以唯(wei)識為(wei)(wei)唯(wei)一標準(zhun)，轉而認為(wei)(wei)凡“外能(neng)利(li)物(wu)，內(nei)以遣憂”之(zhi)學(xue)皆有價值(zhi)，開始對(dui)古(gu)今(jin)中(zhong)(zhong)外的(de)(de)(de)(de)學(xue)術思(si)想(xiang)(xiang)進(jin)行重估。即(ji)進(jin)入“回真向(xiang)俗”的(de)(de)(de)(de)境界。形成章(zhang)太(tai)炎(yan)思(si)想(xiang)(xiang)的(de)(de)(de)(de)背景主要來自四個淵源(yuan)(yuan)：一為(wei)(wei)受乾嘉學(xue)派考證學(xue)的(de)(de)(de)(de)影響，講求客觀實證；二為(wei)(wei)跟隨(sui)晚(wan)清(qing)諸子學(xue)興起的(de)(de)(de)(de)潮流，對(dui)荀子、莊子、老子三(san)家思(si)想(xiang)(xiang)加(jia)以揄揚，尊(zun)子貶孔；三(san)為(wei)(wei)受到嚴復(fu)的(de)(de)(de)(de)影響，在其(qi)早年的(de)(de)(de)(de)文章(zhang)中(zhong)(zhong)尤其(qi)多(duo)以進(jin)化論作為(wei)(wei)理(li)論架構(gou)；四為(wei)(wei)佛(fo)學(xue)，尤其(qi)是(shi)佛(fo)學(xue)中(zhong)(zhong)的(de)(de)(de)(de)唯(wei)識論，是(shi)章(zhang)氏后期思(si)想(xiang)(xiang)的(de)(de)(de)(de)支(zhi)柱，使其(qi)思(si)想(xiang)(xiang)體系中(zhong)(zhong)充(chong)滿個體主義、相對(dui)主義的(de)(de)(de)(de)色(se)彩。除了這四大淵源(yuan)(yuan)外，顧炎(yan)武、王夫之(zhi)的(de)(de)(de)(de)民族(zu)思(si)想(xiang)(xiang)，章(zhang)學(xue)誠、戴震、孫詒讓等人的(de)(de)(de)(de)思(si)想(xiang)(xiang)也對(dui)章(zhang)太(tai)炎(yan)具有相當的(de)(de)(de)(de)影響力。
戊戌變法之(zhi)后(hou)，章太炎(yan)既對(dui)清朝(chao)統(tong)治(zhi)(zhi)不(bu)(bu)(bu)滿(man)，又(you)同情康(kang)、梁；既孕有民族(zu)思想(xiang)，又(you)沒有轉(zhuan)向(xiang)革(ge)命。他(ta)提出(chu)(chu)了“客(ke)帝(di)”和(he)“分(fen)鎮(zhen)(zhen)(zhen)(zhen)”的(de)課題(ti)，認為滿(man)洲(zhou)貴族(zu)，是(shi)客(ke)帝(di)；中國(guo)的(de)“共主(zhu)”應為“仲尼(ni)之(zhi)世胄(zhou)”。只要清朝(chao)皇帝(di)承認過(guo)去民族(zu)壓迫的(de)錯誤，擁護孔子(zi)后(hou)裔，做“虛君”，自(zi)(zi)(zi)己退居為齊桓公(gong)、晉文(wen)公(gong)般的(de)霸主(zhu)，發憤自(zi)(zi)(zi)強，那么反(fan)(fan)滿(man)情緒可以(yi)平(ping)息，可以(yi)防止“逐加于(yu)(yu)滿(man)人(ren)，而(er)(er)地(di)割(ge)于(yu)(yu)白(bai)人(ren)”。“分(fen)鎮(zhen)(zhen)(zhen)(zhen)”也是(shi)章太炎(yan)在(zai)外(wai)國(guo)侵略(lve)、清政腐朽的(de)情況下提出(chu)(chu)的(de)一種改良設想(xiang)。認為政治(zhi)(zhi)危急之(zhi)際，“猶賴有數鎮(zhen)(zhen)(zhen)(zhen)稍自(zi)(zi)(zi)奮起，足以(yi)扶危而(er)(er)定傾(qing)”。因此，不(bu)(bu)(bu)能(neng)削(xue)弱藩(fan)(fan)鎮(zhen)(zhen)(zhen)(zhen)，而(er)(er)“甘心于(yu)(yu)白(bai)種之(zhi)陵籍”。藩(fan)(fan)鎮(zhen)(zhen)(zhen)(zhen)和(he)立憲(xian)(xian)政并不(bu)(bu)(bu)矛盾。“板蕩之(zhi)世，非(fei)得藩(fan)(fan)鎮(zhen)(zhen)(zhen)(zhen)以(yi)尊攘(rang)，則憲(xian)(xian)政不(bu)(bu)(bu)立”。他(ta)舉明治(zhi)(zhi)維新(xin)為例，“若皇德貞(zhen)觀，廓夷歸章，示民版法，陶冶天下，而(er)(er)歸之(zhi)一憲(xian)(xian)，藩(fan)(fan)鎮(zhen)(zhen)(zhen)(zhen)將奔走趨令，如日本之(zhi)薩、長(chang)二藩(fan)(fan)，始(shi)于(yu)(yu)建功，而(er)(er)終于(yu)(yu)納土，何惠(hui)自(zi)(zi)(zi)擅？”此后(hou)，進(jin)而(er)(er)指出(chu)(chu)：“瓜分(fen)而(er)(er)授之(zhi)外(wai)人(ren)，孰與瓜分(fen)而(er)(er)授之(zhi)方鎮(zhen)(zhen)(zhen)(zhen)。”他(ta)反(fan)(fan)對(dui)滿(man)洲(zhou)貴族(zu)統(tong)治(zhi)(zhi)的(de)喪(sang)權辱國(guo)，而(er)(er)對(dui)漢族(zu)地(di)主(zhu)階級還(huan)存幻想(xiang)。他(ta)向(xiang)往的(de)還(huan)是(shi)明治(zhi)(zhi)維新(xin)式的(de)“革(ge)政”。在(zai)旅(lv)臺期間，他(ta)曾將所(suo)寫論文(wen)匯成《訄(qiu)書(shu)》。光緒二十(shi)五年(nian)5月，由(you)基隆去日本，7月下旬，由(you)日返國(guo)。
章(zhang)(zhang)太炎(yan)認(ren)為共(gong)(gong)和(he)政(zheng)(zheng)體(ti)(ti)不如專制(zhi)政(zheng)(zheng)體(ti)(ti)。章(zhang)(zhang)太炎(yan)闡述的(de)，有三層(ceng)意(yi)思(si)：代(dai)議制(zhi)的(de)民主共(gong)(gong)和(he)政(zheng)(zheng)體(ti)(ti)不能行(xing)之(zhi)于(yu)中國；政(zheng)(zheng)黨與議員勾結，這種共(gong)(gong)和(he)政(zheng)(zheng)體(ti)(ti)還不如專制(zhi)政(zheng)(zheng)體(ti)(ti)為宜。結論是(shi)建立共(gong)(gong)和(he)政(zheng)(zheng)體(ti)(ti)只能是(shi)不得(de)已(yi)之(zhi)舉。認(ren)為清(qing)朝推翻后，中國還是(shi)行(xing)專制(zhi)政(zheng)(zheng)體(ti)(ti)為好(hao)。
章太炎早年在日本(ben)主編《民報》時(shi)，曾主張社(she)會(hui)主義，與片(pian)山(shan)潛等(deng)日本(ben)社(she)會(hui)主義者過(guo)從(cong)甚密，并(bing)由此反(fan)思西(xi)方的(de)進(jin)(jin)化(hua)論及現代(dai)文明，撰寫了《俱分進(jin)(jin)化(hua)論》、《五無論》等(deng)著作。
章(zhang)太(tai)炎是(shi)近代中國(guo)國(guo)學(xue)大師，也(ye)是(shi)學(xue)者型的(de)資(zi)產階級(ji)革(ge)命家(jia)；但學(xue)術與(yu)政治畢竟不同，政治方面，章(zhang)太(tai)炎確(que)有他的(de)局限(xian)，這些(xie)(xie)局限(xian)在辛亥革(ge)命及(ji)民國(guo)初年表現得(de)很(hen)明顯。章(zhang)太(tai)炎的(de)一些(xie)(xie)主張(zhang)與(yu)孫中山不同，但他仍是(shi)一位有功于(yu)辛亥革(ge)命的(de)民主革(ge)命宣(xuan)傳家(jia)。
胡適(shi)則(ze)在《五十年(nian)來(lai)(lai)中(zhong)國之文(wen)(wen)學(xue)》（1922年(nian)）中(zhong)說：“章炳麟的(de)(de)古文(wen)(wen)學(xue)是五十年(nian)來(lai)(lai)的(de)(de)第一(yi)作家，這(zhe)是無(wu)可疑的(de)(de)。但他的(de)(de)成績只(zhi)夠(gou)替古文(wen)(wen)學(xue)做(zuo)一(yi)個很光榮的(de)(de)下場，仍舊不能救古文(wen)(wen)學(xue)的(de)(de)必死之癥，仍舊不能做(zuo)到那‘取千(qian)年(nian)朽蠹之馀，反(fan)之正則(ze)’的(de)(de)盛業。”
梁(liang)啟(qi)超《清(qing)代學(xue)術概論》（1922年）稱章太炎為(wei)清(qing)學(xue)正統(tong)派的(de)“殿軍”。
魯迅在1936年臨(lin)終時回憶(yi)其師章太(tai)炎：“考其生(sheng)平，以大(da)勛章作扇墜，臨(lin)總統府(fu)之(zhi)門(men)，大(da)詬袁世(shi)凱包藏禍心者，并(bing)世(shi)無第(di)二人(ren)；七(qi)被追捕，三入牢獄，而革(ge)命之(zhi)志(zhi)終不屈撓(nao)者，并(bing)世(shi)亦無第(di)二人(ren)。這才是先哲的(de)精神，后生(sheng)的(de)楷模。”
汪炳評價他是一位“有革(ge)命業績的(de)學問(wen)家”。
薛慧山說他是(shi)“權(quan)威性的(de)國(guo)學大師(shi)，推翻(fan)滿清的(de)革命先進”。
謝俊美(mei)認(ren)為他應該(gai)是一位(wei)“有革(ge)命(ming)業績的大(da)學問家”。
