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基因芯片是什么 基因芯片檢測技術的原理和特點

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摘要:基因芯片又稱生物芯片或DNA芯片,它們起源于DNA雜交探針技術與半導體工業技術相結合的結晶。該技術系指將大量探針分子固定于支持物上后與帶熒光標記的DNA或其他樣品分子(例如蛋白,因子或小分子)進行雜交,通過檢測每個探針分子的雜交信號強度進而獲取樣品分子的數量和序列信息。下面小編就介紹一下基因芯片的原理與特點。

一、基因芯片是什么

通過微加工技術 ,將數以萬計、乃至百萬計的特定序(xu)列(lie)的DNA片段(基因探針),有規律地(di)排列(lie)固(gu)定于(yu)2cm2 的硅片(pian)、玻片(pian) 等支持物上,構成(cheng)的一(yi)個二維DNA探針陣列,與(yu)計算機的(de)電(dian)子(zi)芯片(pian)十分相似,所以被稱為(wei)基因芯片(pian)。

基(ji)(ji)因(yin)芯片的測(ce)序(xu)原理是(shi)雜(za)交測(ce)序(xu)方法,即通過與一組已知(zhi)序(xu)列的核(he)酸(suan)探(tan)針(zhen)雜(za)交進(jin)行核(he)酸(suan)序(xu)列測(ce)定的方法,在一塊(kuai)基(ji)(ji)片表(biao)面(mian)固定了序(xu)列已知(zhi)的靶核(he)苷酸(suan)的探(tan)針(zhen)。當溶液中帶(dai)有熒光(guang)標記(ji)的核(he)酸(suan)序(xu)列TATGCAATCTAG,與基因芯片上(shang)對應位置(zhi)的(de)(de)核酸探針(zhen)產生互補匹配時(shi),通過確定熒光強(qiang)度(du)最強(qiang)的(de)(de)探針(zhen)位置(zhi),獲得一組序列完全互補的(de)(de)探針(zhen)序列。據此可重組出靶核酸的(de)(de)序列。

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二、基因芯片技術原理

1DNA探針的大(da)量收(shou)集和純(chun)化,基因芯(xin)片探針制(zhi)備方法可(ke)以(yi)是根據基因設計(ji)特(te)異性的PCR引(yin)物,對基因進(jin)行特異性地擴張(zhang),也(ye)可以(yi)是建立均一化的DNA文(wen)庫,通(tong)過克隆(long)鑒定、篩選(xuan)、擴增(zeng)產(chan)生(sheng);

2、將(jiang)純化后(hou)的探(tan)(tan)針固定在片(pian)基上,首先要將(jiang)基片(pian)(主要用的是玻(bo)璃片(pian))進行特殊的化學(xue)處(chu)理(li),使(shi)玻(bo)璃片(pian)醛基化或氨基化,然后(hou)將(jiang)純化的探(tan)(tan)針通過顯(xian)微打(da)印(yin)(yin)或噴打(da)在基片(pian)上,再將(jiang)打(da)印(yin)(yin)好的玻(bo)璃片(pian)進行后(hou)處(chu)理(li),如(ru)水合化、加(jia)熱或紫外交聯等(deng);

3、樣品的(de)標記,標記的(de)方法一般是采用逆轉錄法或隨(sui)機引物(wu)延伸法等;

4、雜交后芯(xin)片的掃描、圖像處理(li)的采集(ji)和數據(ju)分(fen)析。

、基因芯片的特點

1、高(gao)通量、多參數(shu)同步(bu)分析

目前基因芯片制(zhi)作工藝(yi)可達(da)到在(zai)1cm2的載(zai)體(ti)平面上固定(ding)數萬(wan)至數十萬(wan)的探針,可對樣品中數量巨大的相關基(ji)因,甚(shen)至整個(ge)基(ji)因組(zu)及信(xin)息進行同步(bu)檢測(ce)和分析(xi)。

2、快速全(quan)自動分析

在一(yi)定(ding)的條件下使樣品中的靶基因片段同時與芯片的多個探針(zhen)進行雜(za)交(jiao),并(bing)采用掃描(miao)儀器(qi)測量(liang)雜(za)交(jiao)信號和(he)分(fen)析處理數據。從而(er),從根本上(shang)提高了測量(liang)工作(zuo)的速度(du)和(he)效率,也(ye)極大降低了測量(liang)工作(zuo)的強度(du)和(he)難度(du)。

3、高(gao)精確度分析(xi)

由于芯片上(shang)的每(mei)一(yi)點(dian),即每(mei)個(ge)(ge)探針都可(ke)以精(jing)確定位(wei)和選址,加(jia)上(shang)每(mei)個(ge)(ge)探針都可(ke)以精(jing)確設計(ji)及制備(bei),因(yin)此可(ke)以精(jing)確檢測出不同的靶基因(yin)、同一(yi)靶基因(yin)不同的狀態以及在一(yi)個(ge)(ge)堿基上(shang)的差別(bie)。

4、高精(jing)密度(du)分(fen)析

商品化芯片(pian)制作上的精密(mi)(mi)及檢測(ce)(ce)試劑(ji)和(he)方(fang)法上的統一(yi)在一(yi)定程度上保證了芯片(pian)檢測(ce)(ce)的高精密(mi)(mi)度和(he)重(zhong)現性,使不同批次乃(nai)至不同實驗(yan)室之間(jian)的檢測(ce)(ce)結果(guo),可(ke)以進行(xing)有效比對及分析。

5、高(gao)靈敏度分析

基因芯(xin)片選用了不易產生擴(kuo)散作用的(de)(de)(de)載體,探針及樣品(pin)靶基因的(de)(de)(de)的(de)(de)(de)雜交點非常集中,加上雜交前(qian)樣品(pin)靶基因的(de)(de)(de)擴(kuo)增和雜交后(hou)檢測(ce)信(xin)號的(de)(de)(de)擴(kuo)張,極大地(di)提高(gao)了檢測(ce)的(de)(de)(de)靈敏度,可以(yi)檢測(ce)出1個細胞中低至1個(ge)拷(kao)貝(bei)的靶基因,從(cong)而使檢測所需的樣品(pin)量(liang)大(da)幅度減(jian)少,一(yi)般只需要1020μL樣品。

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