元世祖至元年間(1282-1294年),天妃廟始建。
泰(tai)定三年(1326年),重(zhong)建天妃廟(miao),時稱(cheng)東廟(miao)。
明萬歷六(liu)年(1578年),天(tian)妃靈慈宮(gong)重(zhong)修。
清代(dai),天妃靈慈宮數次修葺。
清(qing)光緒(xu)二十六年(1900年),天妃靈慈宮毀于庚(geng)子戰爭(zheng)。
光緒三十一(yi)年(1905年),復(fu)建天妃宮大(da)殿3間。
1950年(nian)以后,天妃宮逐(zhu)漸成為遺址。
1987年(nian),天(tian)津(jin)(jin)市文物普查,對天(tian)妃(fei)宮遺址登記造冊并存于(yu)天(tian)津(jin)(jin)市文化局文物處(chu)和(he)河東區文化局。
1998年12月-1999年1月,天津市非物質文化(hua)遺(yi)產保護(hu)中(zhong)心對天妃宮遺(yi)址進(jin)行考古發掘。
2000年9月(yue),中(zhong)華人民共和國國家文(wen)(wen)物局(ju)專家組對天妃(fei)宮遺(yi)址進行(xing)鑒定,確認大直(zhi)沽是天津歷史文(wen)(wen)化的原(yuan)生(sheng)點,天妃(fei)宮是該原(yuan)生(sheng)點的重要(yao)標志之一。
2001年,天津(jin)市人(ren)民(min)政(zheng)府做出(chu)了(le)在(zai)天妃宮原(yuan)址上建立元明(ming)清(qing)天妃宮遺址博物館的(de)決定;同年8月10 日,元明(ming)清(qing)天妃宮遺址博物館正式開工修建。
2002年,在天(tian)妃宮原址上興建的(de)元明清(qing)天(tian)妃宮遺址博物(wu)館正式(shi)開(kai)館。
天(tian)妃宮遺址位(wei)于天(tian)津市河(he)東(dong)區大直沽中(zhong)(zhong)路(lu),坐落在古文化街中(zhong)(zhong)心(xin)處三(san)岔口(kou)西(xi)岸(an),坐西(xi)朝(chao)東(dong),面向海(hai)河(he),與天(tian)津衛城東(dong)門(men)外三(san)岔口(kou)海(hai)河(he)西(xi)岸(an)的天(tian)后宮,東(dong)西(xi)相望,成(cheng)為海(hai)運(yun)和(he)內河(he)漕(cao)運(yun)的交匯點,占(zhan)地(di)面積5800平(ping)方米,建(jian)筑面積3000平(ping)方米,有大殿(dian)(dian)、后殿(dian)(dian)、東(dong)西(xi)配殿(dian)(dian)、二門(men)、山(shan)門(men)、戲樓(lou)等建(jian)筑。
1997年(nian)9月(yue)至(zhi)10月(yue),在天妃宮遺址范圍內相(xiang)繼發(fa)現了(le)明代(dai)重修(xiu)敕(chi)建(jian)靈(ling)慈宮天妃碑(bei)(bei)記(ji)殘石質碑(bei)(bei)首,碑(bei)(bei)高2.6米,寬0.9米,13行,行40字,正書,上有重修(xiu)敕(chi)建(jian)4個殘字和(he)龍紋,并發(fa)現了(le)石質龜形(xing)碑(bei)(bei)座。1998年(nian)12月(yue)-1999年(nian)1月(yue),天妃宮遺址出土(tu)了(le)元代(dai)藍色琉璃(li)(li)筒瓦、明代(dai)綠色琉璃(li)(li)筒瓦和(he)清(qing)代(dai)脊飾筒瓦等(deng)元、明、清(qing)建(jian)筑(zhu)構件和(he)生活用(yong)品。
2002年,在天(tian)(tian)妃宮(gong)原址上興建的元明(ming)清天(tian)(tian)妃宮(gong)遺址博物(wu)館正式開(kai)館,陳列由4個部(bu)分(fen)組成:第(di)一(yi)部(bu)分(fen)“浩瀚的海洋”,講(jiang)述(shu)了(le)中(zhong)國古代先(xian)民對于海洋的認識和(he)(he)利用(yong);第(di)二部(bu)分(fen)“神氣的媽祖(zu)”,講(jiang)述(shu)了(le)媽祖(zu)崇拜(bai)的產生、演變和(he)(he)流(liu)傳;第(di)三部(bu)分(fen)“海與河的城(cheng)市”,講(jiang)述(shu)了(le)天(tian)(tian)津古代城(cheng)市的形成、發展和(he)(he)海洋的關(guan)系;第(di)四部(bu)分(fen)“永恒的遺址”,講(jiang)述(shu)了(le)天(tian)(tian)妃宮(gong)遺址的考(kao)古發掘(jue)。
2006年5月25日,天妃宮遺址被中華人民(min)共和國國務院公布為第(di)六(liu)批全國重點文(wen)物保護單位。
2017年(nian),元明(ming)清天(tian)妃宮遺(yi)址(zhi)(zhi)博物(wu)館聯合(he)天(tian)津地區(qu)其他博物(wu)館在征詢專家意見(jian)后(hou),從天(tian)妃宮遺(yi)址(zhi)(zhi)出土文物(wu)中篩選(xuan)出189件(套(tao))西周至清代時期的金屬(shu)文物(wu)器進行保護(hu)修復。
天妃宮遺址是中國海上漕運發達(da)的(de)重要(yao)遺存,是天津城市原生點的(de)標志,對研究(jiu)中國海上漕運、天津港口文化和天津城市胚胎的(de)早期聚落(luo)具有重要(yao)價值(zhi)。
元(yuan)定都(dou)大都(dou)(北(bei)京)后,為(wei)解決大都(dou)的糧食供(gong)應問題,開辟(pi)了東(dong)南沿(yan)(yan)海(hai)到直(zhi)沽的漕運,東(dong)南沿(yan)(yan)海(hai)的糧食等物資源源不斷地運往大都(dou);為(wei)了保證海(hai)上航行(xing)的安(an)全,元(yuan)政(zheng)府(fu)于元(yuan)世祖(zu)至元(yuan)年(nian)間(1282-1294年(nian))在大直(zhi)沽修建了天妃靈慈(ci)宮(gong),這是中國北(bei)方地區年(nian)代較早的媽祖(zu)廟(miao)(miao),與福(fu)建湄州媽祖(zu)廟(miao)(miao)、臺灣(wan)北(bei)港朝天宮(gong)并(bing)稱為(wei)中國三(san)大媽祖(zu)廟(miao)(miao)。